Les anticorps sont des médicaments dont l’efficacité a été largement démontrée, environ 70 ont déjà été approuvés pour l’usage médical, plus de 500 font l’objet d’essais cliniques, et encore plus sont en développement pré-clinique. Une étape importante dans la caractérisation et la protection d’un anticorps thérapeutique est la détermination de son épitope. La méthode reine est la structure tridimensionnelle du complexe avec la cible par cristallographie ou RMN, ce qui reste néanmoins une tâche difficile et dont l’issue est incertaine. Nous avons développé MAbTope, une méthode, basée sur l’amarrage protéine-protéine, et qui permet la prédiction de l’épitope, associée à des procédés relativement simples permettant la validation de cette prédiction. Nous montrons que MAbTope prédit l’épitope correct dans chacun des 129 exemples testés de complexes anticorps-antigène de structure tridimensionnelle connue. Nous validons également cette méthode par la prédiction et la validation expérimentale des épitopes reconnus par deux anticorps thérapeutiques ciblant le TNF-α (tumor necrosis factor α) : le certolizumab et le golimumab.
Référence: MAbTope: A Method for Improved Epitope Mapping. Thomas Bourquard, Astrid Musnier, Vincent Puard, Shifa Tahir, Mohammed Akli Ayoub, Yann Jullian, Thomas Boulo, Nathalie Gallay, Hervé Watier, Gilles Bruneau, Eric Reiter, Pascale Crépieux and Anne Poupon. J Immunol, 2018, 201 (10) 3096-3105.